深圳市康宁医院成立于1984年，前身为深圳市精神病医院。在20余年的发展建设中，深圳市康宁医院坚持“以病人为中心”，秉承“心理健康以人为本”的理念，已成为一所集医教研防于一体的市属精神卫生专科医院。
深圳市康宁医院是国家二级甲等医院，广东省百家文明医院，卫生部“健康家园” 定点医院。是深圳市社保局定点医疗单位和深圳市心理卫生协会、深圳市心理危机干预中心挂靠单位，同时是暨南大学医学院、皖南医学院、华中科技大学、广东医学院的教学医院（基地），深圳大学师范学院实习基地。深圳市精神卫生中心与深圳市康宁医院合署办公。深圳市精神卫生研究所设在这里。
目前，深圳市康宁医院定编床位200张（实际开放床位310张），扩建后可达300张。现有职工400余人，在编在岗的266人中，博士8人、硕士15人、本科82人，正高职16人、副高职35人、中级69人、初级115人（数据截至2008年6月30日）。
医院设有：普通精神科、老年精神科、儿童青少年心理科、儿童康复教育科、心理危机干预中心、心理培训中心、心理咨询科、性医学科、心理评估中心、法医精神科、中医科等。住院部设一个心理治疗病区、四个精神科病区。现已实现了住院病人的分级开放管理。
市精神卫生中心作为全市的精神卫生防治工作机构，承担全市精神卫生防治和康复指导工作，以（中心）康宁医院为核心覆盖全市六区的四级精防网络已初步建成。目前，精神病防治康复工作已纳入全市公共卫生体系；建立了深圳市精神卫生信息管理系统，实现了对全市精神病患者的电脑化管理。关爱深圳户籍低保贫困精神病人，实施减免相关医药费用的政策。
2005年由深圳市卫生局、公安局、劳动与社保局、民政局和市残联组织、深圳市康宁医院具体执行，开展了深圳市居民精神疾病流行病学调查，了解18岁及以上人群各类精神疾病的患病率和分布特点，为制定深圳市精神卫生规划提供客观依据。该“流调”结果为18岁以上的深圳居民精神疾病总患病率为21.19％。
精神卫生研究所设临床精神病学、临床心理学、社会精神病学、儿童心理卫生、生物精神病学及电生理等研究室，在精神药物学、情感障碍分子遗传学等研究领域处于全国先进行列。
法医精神病司法鉴定所，面向社会提供精神病司法鉴定、伤残鉴定等服务，拥有ERP等先进设备和“二项必选数字记忆测验”等科研成果。
深圳市康宁医院承担着全市心理危机干预各项培训任务，是我市惟一经市劳动和社会保障局培训处审核、广东省劳动厅就业培训处批准的在深圳开展心理咨询师培训的专门机构。作为深圳市心理咨询师培训基地，多年来为社会培训出大量的心理咨询师。
深圳市康宁医院每年都承担多项省市各级科研课题，同时与其他医院和大学科研院所开展横向科研协作；研究成果获深圳市科技进步奖多项，在国内外杂志和省级以上杂志共发表学术论文数百篇。广泛开展与国内外科研机构的学术交流，极大地促进了医院医疗技术和科研水平的提高。
深圳市康宁医院承担着医学院本科生、心理学系学生、护理本科生临床实习和各地进修生的带教任务。经常承办和省、市级继续教育项目或受委托协办国际性学术会议。
在市委、市政府以及市卫生局的领导下，深圳市康宁医院不断发展提高，享誉华南地区，目前正进入快速发展时期。
面对社会对精神卫生保健服务的巨大需求，深圳市康宁医院在市委、市政府以及市卫生局的正确领导和大力支持下，院领导一班人带领全院职工，以树立大精神卫生观，建立集医疗、防治、康复、科研、教学于一体的新的精神卫生防治体系为目标，以高尚的医德，精湛的医术和严谨的医风，提供优质的医疗服务，用勤劳和智慧迎接医院更加美好的明天！